عسل ارگانیک رایحه موجب نزاع مرد و خرس جنگلی شد

نقشه سه کشور شمال اروپا (استونی، فنلاند، سوئد) که از آنها نمونه عسل به دست آمد. اندازه دایره ها تعداد زنبوردارانی را نشان می دهد که نمونه ها از آنها منشا گرفته اند.

کوچکترین دایره ها نشان می دهد که نمونه های عسل ارگانیک رایحه از یک زنبوردار منفرد و دایره های بزرگ از چندین زنبوردار منشا می گیرند. نقشه با برنامه QGIS نسخه 3.10.4 (https://qgis.org/) ایجاد شده است.

برای بررسی تمایز ترکیب طبقه‌بندی نمونه‌های عسل در بین سه کشور، داده‌های گروه‌های طبقه‌بندی گیاهان، باکتری‌ها و قارچ‌ها را در سطوح طبقه‌بندی واحدهای طبقه‌بندی عملیاتی (OTU)، جنس و خانواده، از هر دو بررسی کردیم.

ابتدا، برای نگاه کردن به خوشه‌بندی نمونه‌ها در هر کشور، از مقیاس‌بندی چند بعدی غیرمتریک (NMDS)24 استفاده کردیم. دوم، برای ارزیابی میزان اشتراک کشورها در این گونه، نمودارهای اویلر25 را ساختیم.

سوم، ما تعیین کردیم که چقدر از تنوع در ترکیب گونه‌ها در بین نمونه‌ها توسط کشور با برازش مدل‌های توزیع مشترک 26 برای هر یک از مجموعه‌های داده توضیح داده شده است.

برای ارزیابی اینکه چگونه حذف گرده و سایر ذرات بزرگتر بر اطلاعات موجود از عسل با شناسایی مبتنی بر DNA تأثیر می گذارد، نمونه های فیلتر شده و فیلتر نشده را با نمودارهای NMDS25 و نمودارهای اویلر24 بررسی کردیم.

برای توضیح دقیق روش ها و تجزیه و تحلیل، به بخش روش ها مراجعه کنید. از نمونه‌های عسل فنلاند، سوئد و استونی، گیاهانی را با مناطق ژنی ITS2، rbcLa و trnL، باکتری‌هایی با ناحیه ژنی 16S rRNA با دو جفت آغازگر (در اینجا 16Sa و 16Sb نامیده می‌شوند).

قارچ‌هایی را با ناحیه ژنی ITS شناسایی کردیم. metabarcoding (جدول تکمیلی S2). برای این تعداد خواندن به دست آمده از توالی یابی در میان مناطق ژن متفاوت است.

از یک میلیون (برای trnL) تا نزدیک به هفت میلیون (برای 16S rRNA با جفت آغازگر 16Sa) خوانده های انتهای جفتی.بر اساس تخصیص تاکسونومیک متابارکدینگ و داده‌های متاژنومیکس و همچنین شناسایی مورفولوژیکی گرده، ارگانیسم‌های متنوعی از نمونه‌های عسل شناسایی شدند.